I didn't grasp that.
I didn't quite understand that.
I didn't really get that.
Just now, what did you say?
That was unexpected, I'm not sure what you mean.
I'm not sure what you just said.
Our wires got crossed, repeat that?
Je n'ai pas compris.
Je n'ai pas tout à fait compris.
Qu'est-ce que tu viens de dire ?
Je ne m'attendais pas à ça, je ne suis pas sûr de comprendre.
Je n'ai pas compris ce que vous venez de dire.
Je n'ai pas compris, pouvez-vous répéter ?